Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms