Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFF3Q07654 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms