Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4BQ07343 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms