Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK18Q07002 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK18Q07002 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK18Q07002 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK18Q07002 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK18Q07002 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK18Q07002 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK18Q07002 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK18Q07002 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK18Q07002 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK18Q07002 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDK18Q07002 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK18Q07002 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms