Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	snR189	snR189	189 nt		3.18	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	TAZ1	YPR140W	1146 nt		3.18	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	RXT2	YBR095C	1293 nt		3.18	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	RAD18	YCR066W	1464 nt		3.17	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	SOK1	YDR006C	2706 nt		3.17	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	RAX2	YLR084C	3663 nt		3.17	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YGL109W	YGL109W	324 nt		3.17	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	NBP1	YLR457C	960 nt		3.17	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YOR385W	YOR385W	873 nt		3.17	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	RPC40	YPR110C	1008 nt		3.17	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	CBP6	YBR120C	489 nt		3.17	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	POP7	YBR167C	423 nt		3.17	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YDR061W	YDR061W	1620 nt		3.17	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	NUR1	YDL089W	1455 nt		3.16	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	ATG13	YPR185W	2217 nt		3.16	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YPP1	YGR198W	2454 nt		3.16	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	FUS2	YMR232W	2034 nt		3.16	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YEA4	YEL004W	1029 nt		3.16	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YER158W-A	YER158W-A	216 nt		3.16	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	TAD1	YGL243W	1203 nt		3.16	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	GIM5	YML094W	492 nt		3.16	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YNL050C	YNL050C	813 nt		3.16	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YNL089C	YNL089C	477 nt		3.16	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	SRL4	YPL033C	846 nt		3.16	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YHR078W	YHR078W	1659 nt		3.16	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	CWH41	YGL027C	2502 nt		3.16	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	GYP7	YDL234C	2241 nt		3.15	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	snR70	snR70	164 nt		3.15	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	UBC13	YDR092W	462 nt		3.15	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	RAV2	YDR202C	1056 nt		3.15	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YDR203W	YDR203W	318 nt		3.15	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YGR121W-A	YGR121W-A	216 nt		3.15	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	LIN1	YHR156C	1023 nt		3.15	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YKL070W	YKL070W	510 nt		3.15	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YKR033C	YKR033C	426 nt		3.15	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YNL109W	YNL109W	546 nt		3.15	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	RRP15	YPR143W	753 nt		3.15	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	ERG11	YHR007C	1593 nt		3.15	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	TOM70	YNL121C	1854 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YER046W-A	YER046W-A	330 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	LOC1	YFR001W	615 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	tW(CCA)G1	tW(CCA)G1	72 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	tW(CCA)G2	tW(CCA)G2	72 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	tW(CCA)J	tW(CCA)J	72 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	tW(CCA)K	tW(CCA)K	72 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	tW(CCA)M	tW(CCA)M	72 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	tW(CCA)P	tW(CCA)P	72 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YJR020W	YJR020W	333 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	RCN1	YKL159C	636 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YKE2	YLR200W	345 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	PDR17	YNL264C	1053 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	ATP11	YNL315C	957 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	APM3	YBR288C	1452 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	MSH4	YFL003C	2637 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	KRE2	YDR483W	1329 nt		3.14	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	MSB2	YGR014W	3921 nt		3.13	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	BNI4	YNL233W	2679 nt		3.13	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	NSE4	YDL105W	1209 nt		3.13	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	HMO1	YDR174W	741 nt		3.13	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	RRT13	YER066W	558 nt		3.13	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	PGD1	YGL025C	1194 nt		3.13	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	DSE2	YHR143W	978 nt		3.13	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	PRM6	YML047C	1059 nt		3.13	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	BRX1	YOL077C	876 nt		3.13	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	SHG1	YBR258C	429 nt		3.13	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	SEC7	YDR170C	6030 nt		3.13	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	SPP382	YLR424W	2127 nt		3.13	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YDR034C-D	YDR034C-D	5313 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	CEP3	YMR168C	1827 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	AGE1	YDR524C	1449 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	TFC4	YGR047C	3078 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	TAF2	YCR042C	4224 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	RIM1	YCR028C-A	408 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	CPR5	YDR304C	678 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YGL039W	YGL039W	1047 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	RPB9	YGL070C	369 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YGR160W	YGR160W	612 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	EFG1	YGR271C-A	702 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YHR214C-D	YHR214C-D	294 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	ENV10	YLR065C	546 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YLR076C	YLR076C	423 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YAR069C	YAR069C	294 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	JIP3	YLR331C	378 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	RCE1	YMR274C	948 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	DYN3	YMR299C	939 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	ARL3	YPL051W	597 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	SLP1	YOR154W	1764 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	ERT1	YBR239C	1590 nt		3.12	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	JSN1	YJR091C	3276 nt		3.11	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	CAF120	YNL278W	3183 nt		3.11	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	PUF6	YDR496C	1971 nt		3.11	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YPL150W	YPL150W	2706 nt		3.11	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YDR248C	YDR248C	582 nt		3.11	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YJL133C-A	YJL133C-A	225 nt		3.11	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YJL169W	YJL169W	369 nt		3.11	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YPL216W	YPL216W	3309 nt		3.11	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	ANR2	YKL047W	1551 nt		3.11	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	EAP1	YKL204W	1899 nt		3.11	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	NSA1	YGL111W	1392 nt		3.11	□□□□□ -1.91
MRD1	Q06106	YDR098C-B	YDR098C-B	5268 nt		3.11	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.7 ms