Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FPGSQ05932 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FPGSQ05932 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms