Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCDQ05655 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms