Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCZQ05513 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms