Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD164Q04900 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD164Q04900 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD164Q04900 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD164Q04900 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD164Q04900 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD164Q04900 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD164Q04900 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD164Q04900 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD164Q04900 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD164Q04900 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD164Q04900 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD164Q04900 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD164Q04900 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD164Q04900 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD164Q04900 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CD164Q04900 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CD164Q04900 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CD164Q04900 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CD164Q04900 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD164Q04900 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD164Q04900 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms