Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms