Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG6Q00889 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG6Q00889 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms