Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC5Q00444 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms