Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDLBPQ00341 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms