Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMF1P82094 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMF1P82094 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMF1P82094 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMF1P82094 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMF1P82094 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMF1P82094 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMF1P82094 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMF1P82094 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TMF1P82094 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMF1P82094 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TMF1P82094 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMF1P82094 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMF1P82094 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMF1P82094 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMF1P82094 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMF1P82094 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMF1P82094 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMF1P82094 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMF1P82094 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMF1P82094 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMF1P82094 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMF1P82094 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMF1P82094 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMF1P82094 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMF1P82094 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMF1P82094 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMF1P82094 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMF1P82094 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TMF1P82094 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TMF1P82094 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMF1P82094 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMF1P82094 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMF1P82094 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMF1P82094 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMF1P82094 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMF1P82094 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMF1P82094 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMF1P82094 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMF1P82094 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMF1P82094 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMF1P82094 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMF1P82094 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMF1P82094 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMF1P82094 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMF1P82094 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMF1P82094 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMF1P82094 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMF1P82094 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMF1P82094 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMF1P82094 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMF1P82094 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TMF1P82094 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TMF1P82094 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMF1P82094 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMF1P82094 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMF1P82094 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMF1P82094 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TMF1P82094 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMF1P82094 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMF1P82094 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TMF1P82094 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMF1P82094 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMF1P82094 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMF1P82094 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMF1P82094 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMF1P82094 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMF1P82094 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMF1P82094 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMF1P82094 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMF1P82094 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMF1P82094 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMF1P82094 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMF1P82094 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMF1P82094 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMF1P82094 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMF1P82094 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMF1P82094 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMF1P82094 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMF1P82094 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMF1P82094 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMF1P82094 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms