Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JAG1P78504 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
JAG1P78504 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
JAG1P78504 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JAG1P78504 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JAG1P78504 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JAG1P78504 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JAG1P78504 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
JAG1P78504 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JAG1P78504 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JAG1P78504 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAG1P78504 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAG1P78504 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAG1P78504 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAG1P78504 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAG1P78504 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAG1P78504 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAG1P78504 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAG1P78504 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAG1P78504 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAG1P78504 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAG1P78504 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAG1P78504 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JAG1P78504 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JAG1P78504 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JAG1P78504 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JAG1P78504 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JAG1P78504 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
JAG1P78504 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JAG1P78504 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
JAG1P78504 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
JAG1P78504 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JAG1P78504 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
JAG1P78504 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JAG1P78504 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JAG1P78504 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JAG1P78504 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JAG1P78504 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
JAG1P78504 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
JAG1P78504 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
JAG1P78504 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
JAG1P78504 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
JAG1P78504 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JAG1P78504 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JAG1P78504 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JAG1P78504 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JAG1P78504 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
JAG1P78504 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
JAG1P78504 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
JAG1P78504 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
JAG1P78504 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
JAG1P78504 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
JAG1P78504 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JAG1P78504 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JAG1P78504 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
JAG1P78504 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
JAG1P78504 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
JAG1P78504 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
JAG1P78504 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
JAG1P78504 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JAG1P78504 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
JAG1P78504 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
JAG1P78504 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
JAG1P78504 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
JAG1P78504 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JAG1P78504 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
JAG1P78504 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JAG1P78504 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
JAG1P78504 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JAG1P78504 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
JAG1P78504 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JAG1P78504 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JAG1P78504 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAG1P78504 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAG1P78504 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAG1P78504 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAG1P78504 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAG1P78504 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAG1P78504 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAG1P78504 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAG1P78504 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAG1P78504 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAG1P78504 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAG1P78504 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAG1P78504 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAG1P78504 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAG1P78504 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAG1P78504 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAG1P78504 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAG1P78504 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAG1P78504 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAG1P78504 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAG1P78504 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAG1P78504 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAG1P78504 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAG1P78504 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAG1P78504 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
JAG1P78504 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JAG1P78504 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
JAG1P78504 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms