Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2P78314 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2P78314 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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