Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOMO3P69849 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms