Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCCD1P59942 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms