Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EEFSECP57772 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms