Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME5P56597 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME5P56597 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME5P56597 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME5P56597 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME5P56597 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME5P56597 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME5P56597 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME5P56597 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME5P56597 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME5P56597 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME5P56597 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME5P56597 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME5P56597 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME5P56597 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME5P56597 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME5P56597 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME5P56597 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME5P56597 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME5P56597 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME5P56597 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME5P56597 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME5P56597 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME5P56597 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME5P56597 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME5P56597 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME5P56597 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME5P56597 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NME5P56597 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME5P56597 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME5P56597 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME5P56597 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NME5P56597 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms