Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1P56182 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1P56182 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1P56182 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1P56182 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1P56182 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1P56182 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1P56182 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1P56182 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1P56182 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1P56182 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1P56182 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1P56182 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1P56182 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1P56182 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1P56182 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1P56182 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1P56182 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RRP1P56182 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RRP1P56182 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1P56182 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1P56182 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1P56182 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1P56182 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1P56182 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1P56182 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1P56182 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1P56182 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1P56182 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1P56182 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1P56182 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1P56182 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1P56182 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1P56182 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1P56182 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1P56182 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1P56182 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1P56182 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1P56182 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1P56182 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1P56182 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1P56182 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1P56182 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1P56182 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1P56182 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1P56182 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1P56182 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1P56182 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1P56182 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms