Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX9P55771 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX9P55771 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX9P55771 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX9P55771 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX9P55771 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX9P55771 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX9P55771 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX9P55771 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX9P55771 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX9P55771 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX9P55771 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX9P55771 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX9P55771 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX9P55771 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX9P55771 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX9P55771 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX9P55771 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX9P55771 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX9P55771 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX9P55771 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX9P55771 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX9P55771 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX9P55771 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX9P55771 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX9P55771 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX9P55771 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX9P55771 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX9P55771 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX9P55771 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX9P55771 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PAX9P55771 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PAX9P55771 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX9P55771 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX9P55771 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms