Protein–RNA interactions for Protein: P55075

FGF8, Fibroblast growth factor 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF8P55075 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF8P55075 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGF8P55075 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FGF8P55075 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGF8P55075 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FGF8P55075 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGF8P55075 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FGF8P55075 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF8P55075 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGF8P55075 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms