Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLTPP55058 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLTPP55058 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLTPP55058 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PLTPP55058 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PLTPP55058 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLTPP55058 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLTPP55058 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLTPP55058 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLTPP55058 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLTPP55058 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLTPP55058 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLTPP55058 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLTPP55058 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLTPP55058 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLTPP55058 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLTPP55058 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLTPP55058 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLTPP55058 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLTPP55058 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLTPP55058 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLTPP55058 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLTPP55058 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PLTPP55058 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLTPP55058 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLTPP55058 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLTPP55058 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLTPP55058 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLTPP55058 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLTPP55058 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLTPP55058 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLTPP55058 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLTPP55058 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLTPP55058 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLTPP55058 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLTPP55058 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLTPP55058 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLTPP55058 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLTPP55058 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLTPP55058 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLTPP55058 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLTPP55058 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms