Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMP3P54852 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EMP3P54852 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMP3P54852 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMP3P54852 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMP3P54852 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMP3P54852 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMP3P54852 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMP3P54852 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMP3P54852 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMP3P54852 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMP3P54852 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMP3P54852 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMP3P54852 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMP3P54852 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMP3P54852 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP3P54852 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP3P54852 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EMP3P54852 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP3P54852 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP3P54852 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP3P54852 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP3P54852 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP3P54852 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP3P54852 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP3P54852 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP3P54852 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP3P54852 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP3P54852 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP3P54852 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP3P54852 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP3P54852 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP3P54852 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP3P54852 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP3P54852 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMP3P54852 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMP3P54852 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMP3P54852 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMP3P54852 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMP3P54852 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMP3P54852 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMP3P54852 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMP3P54852 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMP3P54852 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMP3P54852 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMP3P54852 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMP3P54852 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms