Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA4P54764 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPHA4P54764 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms