Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms