Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms