Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATXN1P54253 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATXN1P54253 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATXN1P54253 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATXN1P54253 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATXN1P54253 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATXN1P54253 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATXN1P54253 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN1P54253 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms