Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SMARCA4P51532 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SMARCA4P51532 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMARCA4P51532 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms