Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC11A1P49279 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms