Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A3P48751 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A3P48751 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms