Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA4P48058 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA4P48058 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA4P48058 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA4P48058 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA4P48058 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIA4P48058 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA4P48058 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIA4P48058 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA4P48058 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA4P48058 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA4P48058 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIA4P48058 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA4P48058 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA4P48058 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA4P48058 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA4P48058 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA4P48058 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA4P48058 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA4P48058 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA4P48058 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA4P48058 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA4P48058 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA4P48058 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA4P48058 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA4P48058 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA4P48058 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA4P48058 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA4P48058 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA4P48058 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA4P48058 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA4P48058 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA4P48058 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA4P48058 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA4P48058 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA4P48058 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA4P48058 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA4P48058 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIA4P48058 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA4P48058 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA4P48058 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA4P48058 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms