Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB2P47870 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB2P47870 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB2P47870 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB2P47870 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB2P47870 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB2P47870 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB2P47870 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB2P47870 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB2P47870 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB2P47870 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB2P47870 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRB2P47870 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRB2P47870 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRB2P47870 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB2P47870 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms