Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP5P45974 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP5P45974 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP5P45974 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP5P45974 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP5P45974 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP5P45974 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP5P45974 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP5P45974 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP5P45974 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP5P45974 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP5P45974 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP5P45974 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP5P45974 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP5P45974 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP5P45974 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP5P45974 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP5P45974 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP5P45974 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP5P45974 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP5P45974 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP5P45974 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP5P45974 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP5P45974 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP5P45974 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP5P45974 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP5P45974 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP5P45974 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP5P45974 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP5P45974 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP5P45974 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP5P45974 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP5P45974 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP5P45974 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP5P45974 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP5P45974 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP5P45974 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP5P45974 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP5P45974 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP5P45974 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP5P45974 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP5P45974 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP5P45974 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP5P45974 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP5P45974 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP5P45974 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP5P45974 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP5P45974 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP5P45974 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP5P45974 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP5P45974 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP5P45974 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP5P45974 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP5P45974 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP5P45974 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP5P45974 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP5P45974 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP5P45974 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP5P45974 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP5P45974 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms