Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC4P43686 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms