Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA4P43681 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms