Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNCAP37840 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNCAP37840 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNCAP37840 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNCAP37840 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNCAP37840 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNCAP37840 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNCAP37840 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNCAP37840 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNCAP37840 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNCAP37840 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNCAP37840 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNCAP37840 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNCAP37840 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms