Protein–RNA interactions for Protein: P36130

CAF4, CCR4-associated factor 4, yeastyeast

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CAF4P36130 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.15□□□□□ -2.07
CAF4P36130 SFT1YKL006C-A 294 nt2.15□□□□□ -2.07
CAF4P36130 PRM4YPL156C 855 nt2.15□□□□□ -2.07
CAF4P36130 DBF20YPR111W 1695 nt2.15□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YLR108CYLR108C 1458 nt2.14□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YPR097WYPR097W 3222 nt2.14□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YKL075CYKL075C 1353 nt2.14□□□□□ -2.07
CAF4P36130 ISC10YER180C 804 nt2.14□□□□□ -2.07
CAF4P36130 SCL1YGL011C 759 nt2.14□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YGR018CYGR018C 330 nt2.14□□□□□ -2.07
CAF4P36130 RPS25AYGR027C 327 nt2.14□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YGR050CYGR050C 357 nt2.14□□□□□ -2.07
CAF4P36130 MMF1YIL051C 438 nt2.14□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.14□□□□□ -2.07
CAF4P36130 RPA12YJR063W 378 nt2.14□□□□□ -2.07
CAF4P36130 FPR1YNL135C 345 nt2.14□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YOL134CYOL134C 390 nt2.14□□□□□ -2.07
CAF4P36130 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.14□□□□□ -2.07
CAF4P36130 DPB3YBR278W 606 nt2.14□□□□□ -2.07
CAF4P36130 NUP170YBL079W 4509 nt2.13□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.13□□□□□ -2.07
CAF4P36130 AAD16YFL057C 459 nt2.13□□□□□ -2.07
CAF4P36130 DGK1YOR311C 873 nt2.13□□□□□ -2.07
CAF4P36130 SPB1YCL054W 2526 nt2.12□□□□□ -2.07
CAF4P36130 APC11YDL008W 498 nt2.12□□□□□ -2.07
CAF4P36130 BOS1YLR078C 735 nt2.12□□□□□ -2.07
CAF4P36130 LIP2YLR239C 987 nt2.12□□□□□ -2.07
CAF4P36130 SRT1YMR101C 1032 nt2.12□□□□□ -2.07
CAF4P36130 SSE1YPL106C 2082 nt2.12□□□□□ -2.07
CAF4P36130 SDC25YLL016W 3147 nt2.12□□□□□ -2.07
CAF4P36130 MAK5YBR142W 2322 nt2.12□□□□□ -2.07
CAF4P36130 ROY1YMR258C 1662 nt2.12□□□□□ -2.07
CAF4P36130 UTP22YGR090W 3714 nt2.12□□□□□ -2.07
CAF4P36130 USO1YDL058W 5373 nt2.11□□□□□ -2.07
CAF4P36130 RPL27BYDR471W 411 nt2.11□□□□□ -2.07
CAF4P36130 RRF1YHR038W 693 nt2.11□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YKL162CYKL162C 1209 nt2.11□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YLL044WYLL044W 447 nt2.11□□□□□ -2.07
CAF4P36130 AIM36YMR157C 768 nt2.11□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YNL276CYNL276C 396 nt2.11□□□□□ -2.07
CAF4P36130 HAT1YPL001W 1125 nt2.11□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.11□□□□□ -2.07
CAF4P36130 TFB1YDR311W 1929 nt2.11□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YNL018CYNL018C 1839 nt2.1□□□□□ -2.07
CAF4P36130 GCN4YEL009C 846 nt2.1□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YAP5YIR018W 738 nt2.1□□□□□ -2.07
CAF4P36130 UTP30YKR060W 825 nt2.1□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt2.1□□□□□ -2.07
CAF4P36130 ATG19YOL082W 1248 nt2.1□□□□□ -2.07
CAF4P36130 PET100YDR079W 336 nt2.09□□□□□ -2.07
CAF4P36130 FMN1YDR236C 657 nt2.09□□□□□ -2.07
CAF4P36130 ASG7YJL170C 630 nt2.09□□□□□ -2.07
CAF4P36130 VPS51YKR020W 495 nt2.09□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YLR257WYLR257W 966 nt2.09□□□□□ -2.07
CAF4P36130 BET5YML077W 480 nt2.09□□□□□ -2.07
CAF4P36130 DGR1YNL130C-A 147 nt2.09□□□□□ -2.07
CAF4P36130 TEX1YNL253W 1269 nt2.09□□□□□ -2.07
CAF4P36130 MCT1YOR221C 1083 nt2.09□□□□□ -2.07
CAF4P36130 CTP1YBR291C 900 nt2.09□□□□□ -2.07
CAF4P36130 YLR446WYLR446W 1302 nt2.09□□□□□ -2.08
CAF4P36130 BRE1YDL074C 2103 nt2.09□□□□□ -2.08
CAF4P36130 YPP1YGR198W 2454 nt2.09□□□□□ -2.08
CAF4P36130 YRR1YOR162C 2433 nt2.08□□□□□ -2.08
CAF4P36130 TIF35YDR429C 825 nt2.08□□□□□ -2.08
CAF4P36130 SPT15YER148W 723 nt2.08□□□□□ -2.08
CAF4P36130 DDI2YFL061W 678 nt2.08□□□□□ -2.08
CAF4P36130 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt2.08□□□□□ -2.08
CAF4P36130 SLM4YBR077C 489 nt2.08□□□□□ -2.08
CAF4P36130 RGL1YPL066W 1440 nt2.08□□□□□ -2.08
CAF4P36130 MUB1YMR100W 1863 nt2.07□□□□□ -2.08
CAF4P36130 ALK2YBL009W 2031 nt2.07□□□□□ -2.08
CAF4P36130 BIT61YJL058C 1632 nt2.07□□□□□ -2.08
CAF4P36130 AYR1YIL124W 894 nt2.07□□□□□ -2.08
CAF4P36130 RPL36AYMR194W 303 nt2.07□□□□□ -2.08
CAF4P36130 GPI2YPL076W 843 nt2.07□□□□□ -2.08
CAF4P36130 MUM2YBR057C 1101 nt2.07□□□□□ -2.08
CAF4P36130 COS111YBR203W 2775 nt2.07□□□□□ -2.08
CAF4P36130 EMI1YDR512C 564 nt2.06□□□□□ -2.08
CAF4P36130 YGL117WYGL117W 798 nt2.06□□□□□ -2.08
CAF4P36130 SAE2YGL175C 1038 nt2.06□□□□□ -2.08
CAF4P36130 DSE2YHR143W 978 nt2.06□□□□□ -2.08
CAF4P36130 YMR320WYMR320W 306 nt2.06□□□□□ -2.08
CAF4P36130 GRX1YCL035C 333 nt2.06□□□□□ -2.08
CAF4P36130 TRM2YKR056W 1920 nt2.06□□□□□ -2.08
CAF4P36130 RTG3YBL103C 1461 nt2.06□□□□□ -2.08
CAF4P36130 NOP56YLR197W 1515 nt2.06□□□□□ -2.08
CAF4P36130 INP51YIL002C 2841 nt2.05□□□□□ -2.08
CAF4P36130 RGA2YDR379W 3030 nt2.05□□□□□ -2.08
CAF4P36130 VTC1YER072W 390 nt2.05□□□□□ -2.08
CAF4P36130 PAU23YLR037C 375 nt2.05□□□□□ -2.08
CAF4P36130 TSR4YOL022C 1227 nt2.05□□□□□ -2.08
CAF4P36130 SME1YOR159C 285 nt2.05□□□□□ -2.08
CAF4P36130 SLF1YDR515W 1344 nt2.05□□□□□ -2.08
CAF4P36130 SIP3YNL257C 3690 nt2.05□□□□□ -2.08
CAF4P36130 YDR290WYDR290W 330 nt2.04□□□□□ -2.08
CAF4P36130 MIG2YGL209W 1149 nt2.04□□□□□ -2.08
CAF4P36130 VEL1YGL258W 621 nt2.04□□□□□ -2.08
CAF4P36130 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.04□□□□□ -2.08
CAF4P36130 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt2.04□□□□□ -2.08
CAF4P36130 YJL202CYJL202C 348 nt2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 152.4 ms