Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 EMC2YJR088C 879 nt5.28□□□□□ -1.56
CSE4P36012 PAM18YLR008C 507 nt5.28□□□□□ -1.56
CSE4P36012 OST2YOR103C 393 nt5.28□□□□□ -1.56
CSE4P36012 YPR039WYPR039W 336 nt5.28□□□□□ -1.56
CSE4P36012 RPL11AYPR102C 525 nt5.28□□□□□ -1.56
CSE4P36012 DPB3YBR278W 606 nt5.28□□□□□ -1.56
CSE4P36012 VAC8YEL013W 1737 nt5.28□□□□□ -1.56
CSE4P36012 CDC14YFR028C 1656 nt5.28□□□□□ -1.56
CSE4P36012 TPO2YGR138C 1845 nt5.27□□□□□ -1.57
CSE4P36012 AVT7YIL088C 1473 nt5.27□□□□□ -1.57
CSE4P36012 HOYDL227C 1761 nt5.27□□□□□ -1.57
CSE4P36012 VOA1YGR106C 798 nt5.27□□□□□ -1.57
CSE4P36012 OTU2YHL013C 924 nt5.27□□□□□ -1.57
CSE4P36012 TEN1YLR010C 483 nt5.27□□□□□ -1.57
CSE4P36012 RMP1YLR145W 606 nt5.27□□□□□ -1.57
CSE4P36012 RPL6BYLR448W 531 nt5.27□□□□□ -1.57
CSE4P36012 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt5.27□□□□□ -1.57
CSE4P36012 YJL132WYJL132W 2253 nt5.27□□□□□ -1.57
CSE4P36012 EXO1YOR033C 2109 nt5.27□□□□□ -1.57
CSE4P36012 MAK5YBR142W 2322 nt5.26□□□□□ -1.57
CSE4P36012 NNK1YKL171W 2787 nt5.26□□□□□ -1.57
CSE4P36012 YDL009CYDL009C 324 nt5.26□□□□□ -1.57
CSE4P36012 YIL141WYIL141W 390 nt5.26□□□□□ -1.57
CSE4P36012 SUI1YNL244C 327 nt5.26□□□□□ -1.57
CSE4P36012 PPZ1YML016C 2079 nt5.26□□□□□ -1.57
CSE4P36012 YNR065CYNR065C 3351 nt5.25□□□□□ -1.57
CSE4P36012 DSF2YBR007C 2211 nt5.25□□□□□ -1.57
CSE4P36012 PEX30YLR324W 1572 nt5.25□□□□□ -1.57
CSE4P36012 EPO1YMR124W 2832 nt5.25□□□□□ -1.57
CSE4P36012 DBF20YPR111W 1695 nt5.25□□□□□ -1.57
CSE4P36012 IMA1YGR287C 1770 nt5.25□□□□□ -1.57
CSE4P36012 AAD3YCR107W 1092 nt5.25□□□□□ -1.57
CSE4P36012 YER084WYER084W 387 nt5.25□□□□□ -1.57
CSE4P36012 ICY1YMR195W 384 nt5.25□□□□□ -1.57
CSE4P36012 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt5.25□□□□□ -1.57
CSE4P36012 TAF12YDR145W 1620 nt5.25□□□□□ -1.57
CSE4P36012 STP2YHR006W 1626 nt5.25□□□□□ -1.57
CSE4P36012 UTP15YMR093W 1542 nt5.24□□□□□ -1.57
CSE4P36012 RIA1YNL163C 3333 nt5.24□□□□□ -1.57
CSE4P36012 SMX2YFL017W-A 234 nt5.24□□□□□ -1.57
CSE4P36012 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.24□□□□□ -1.57
CSE4P36012 YGR073CYGR073C 372 nt5.24□□□□□ -1.57
CSE4P36012 BIO2YGR286C 1128 nt5.24□□□□□ -1.57
CSE4P36012 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt5.24□□□□□ -1.57
CSE4P36012 RNA14YMR061W 2034 nt5.24□□□□□ -1.57
CSE4P36012 ULP1YPL020C 1866 nt5.24□□□□□ -1.57
CSE4P36012 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt5.23□□□□□ -1.57
CSE4P36012 DFG10YIL049W 762 nt5.23□□□□□ -1.57
CSE4P36012 RRD2YPL152W 1077 nt5.23□□□□□ -1.57
CSE4P36012 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt5.23□□□□□ -1.57
CSE4P36012 snR35snR35 204 nt5.23□□□□□ -1.57
CSE4P36012 BUD14YAR014C 2130 nt5.23□□□□□ -1.57
CSE4P36012 UBP12YJL197W 3765 nt5.22□□□□□ -1.57
CSE4P36012 ARO80YDR421W 2853 nt5.22□□□□□ -1.57
CSE4P36012 YTA6YPL074W 2265 nt5.22□□□□□ -1.57
CSE4P36012 OAF1YAL051W 3144 nt5.22□□□□□ -1.57
CSE4P36012 VPS9YML097C 1356 nt5.22□□□□□ -1.57
CSE4P36012 YGR053CYGR053C 852 nt5.22□□□□□ -1.57
CSE4P36012 YIR014WYIR014W 729 nt5.22□□□□□ -1.57
CSE4P36012 JLP2YMR132C 627 nt5.22□□□□□ -1.57
CSE4P36012 ZEO1YOL109W 342 nt5.22□□□□□ -1.57
CSE4P36012 FZO1YBR179C 2568 nt5.22□□□□□ -1.57
CSE4P36012 POL4YCR014C 1749 nt5.22□□□□□ -1.57
CSE4P36012 YRR1YOR162C 2433 nt5.21□□□□□ -1.58
CSE4P36012 EMI1YDR512C 564 nt5.21□□□□□ -1.58
CSE4P36012 IES6YEL044W 501 nt5.21□□□□□ -1.58
CSE4P36012 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt5.21□□□□□ -1.58
CSE4P36012 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt5.21□□□□□ -1.58
CSE4P36012 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt5.21□□□□□ -1.58
CSE4P36012 VTI1YMR197C 654 nt5.21□□□□□ -1.58
CSE4P36012 RAD14YMR201C 1116 nt5.21□□□□□ -1.58
CSE4P36012 YMR320WYMR320W 306 nt5.21□□□□□ -1.58
CSE4P36012 ERP4YOR016C 624 nt5.21□□□□□ -1.58
CSE4P36012 SRL1YOR247W 633 nt5.21□□□□□ -1.58
CSE4P36012 ATP3YBR039W 936 nt5.21□□□□□ -1.58
CSE4P36012 OLE1YGL055W 1533 nt5.2□□□□□ -1.58
CSE4P36012 RRN11YML043C 1524 nt5.2□□□□□ -1.58
CSE4P36012 YDR090CYDR090C 933 nt5.2□□□□□ -1.58
CSE4P36012 YDR526CYDR526C 471 nt5.2□□□□□ -1.58
CSE4P36012 RPA12YJR063W 378 nt5.2□□□□□ -1.58
CSE4P36012 RAD53YPL153C 2466 nt5.19□□□□□ -1.58
CSE4P36012 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt5.19□□□□□ -1.58
CSE4P36012 RPS0AYGR214W 759 nt5.19□□□□□ -1.58
CSE4P36012 UBC7YMR022W 498 nt5.19□□□□□ -1.58
CSE4P36012 IST1YNL265C 897 nt5.19□□□□□ -1.58
CSE4P36012 HUB1YNR032C-A 222 nt5.19□□□□□ -1.58
CSE4P36012 SIN4YNL236W 2925 nt5.19□□□□□ -1.58
CSE4P36012 TDA1YMR291W 1761 nt5.19□□□□□ -1.58
CSE4P36012 PDR12YPL058C 4536 nt5.18□□□□□ -1.58
CSE4P36012 YGR117CYGR117C 1431 nt5.18□□□□□ -1.58
CSE4P36012 SGN1YIR001C 753 nt5.18□□□□□ -1.58
CSE4P36012 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt5.18□□□□□ -1.58
CSE4P36012 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt5.18□□□□□ -1.58
CSE4P36012 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt5.18□□□□□ -1.58
CSE4P36012 APC5YOR249C 2058 nt5.18□□□□□ -1.58
CSE4P36012 JIP5YPR169W 1479 nt5.18□□□□□ -1.58
CSE4P36012 RIM13YMR154C 2184 nt5.18□□□□□ -1.58
CSE4P36012 MNR2YKL064W 2910 nt5.17□□□□□ -1.58
CSE4P36012 BBC1YJL020C 3474 nt5.17□□□□□ -1.58
CSE4P36012 NOP6YDL213C 678 nt5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.9 ms