Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPB2P35606 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB2P35606 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB2P35606 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB2P35606 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB2P35606 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB2P35606 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB2P35606 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB2P35606 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB2P35606 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB2P35606 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB2P35606 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB2P35606 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB2P35606 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB2P35606 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB2P35606 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPB2P35606 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPB2P35606 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPB2P35606 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB2P35606 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB2P35606 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB2P35606 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB2P35606 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB2P35606 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB2P35606 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB2P35606 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB2P35606 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB2P35606 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB2P35606 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB2P35606 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB2P35606 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB2P35606 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB2P35606 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB2P35606 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB2P35606 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB2P35606 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB2P35606 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB2P35606 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB2P35606 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB2P35606 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB2P35606 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB2P35606 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB2P35606 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB2P35606 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB2P35606 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB2P35606 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB2P35606 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB2P35606 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB2P35606 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB2P35606 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB2P35606 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB2P35606 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB2P35606 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB2P35606 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB2P35606 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB2P35606 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB2P35606 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB2P35606 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB2P35606 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB2P35606 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB2P35606 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB2P35606 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB2P35606 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB2P35606 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB2P35606 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB2P35606 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB2P35606 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB2P35606 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB2P35606 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB2P35606 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB2P35606 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB2P35606 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB2P35606 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms