Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
THBS4P35443 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
THBS4P35443 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
THBS4P35443 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
THBS4P35443 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
THBS4P35443 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
THBS4P35443 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
THBS4P35443 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
THBS4P35443 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
THBS4P35443 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
THBS4P35443 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
THBS4P35443 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
THBS4P35443 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
THBS4P35443 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
THBS4P35443 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
THBS4P35443 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
THBS4P35443 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
THBS4P35443 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
THBS4P35443 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS4P35443 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS4P35443 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS4P35443 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS4P35443 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS4P35443 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS4P35443 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS4P35443 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS4P35443 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS4P35443 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS4P35443 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS4P35443 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS4P35443 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS4P35443 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS4P35443 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS4P35443 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
THBS4P35443 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
THBS4P35443 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
THBS4P35443 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
THBS4P35443 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS4P35443 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS4P35443 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS4P35443 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms