Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC1P33527 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms