Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	tV(CAC)D	tV(CAC)D	73 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	tV(CAC)H	tV(CAC)H	73 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	PDP3	YLR455W	915 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	ADI1	YMR009W	540 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YNL057W	YNL057W	333 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YPL142C	YPL142C	318 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YPR012W	YPR012W	255 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	DAL5	YJR152W	1632 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	TMA64	YDR117C	1698 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	TAF1	YGR274C	3201 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YDR431W	YDR431W	312 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YER084W-A	YER084W-A	513 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	PUG1	YER185W	912 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YKL044W	YKL044W	321 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YKT6	YKL196C	603 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	RPL15A	YLR029C	615 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	RIM9	YMR063W	720 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	TVP18	YMR071C	504 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	PDS5	YMR076C	3834 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YMR173W-A	YMR173W-A	1185 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	BUD21	YOR078W	645 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YBR062C	YBR062C	543 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	FOX2	YKR009C	2703 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	CBP2	YHL038C	1893 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	UBP16	YPL072W	1500 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	CIN1	YOR349W	3045 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	VFA1	YER128W	612 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YER165C-A	YER165C-A	357 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	ECO1	YFR027W	846 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YHR130C	YHR130C	336 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	EAP1	YKL204W	1899 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YLR154W-F	YLR154W-F	141 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YLR171W	YLR171W	390 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	SAS2	YMR127C	1017 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	NTC20	YBR188C	423 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	ATP25	YMR098C	1839 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	RTT105	YER104W	627 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YGR161W-C	YGR161W-C	279 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	tR(ACG)Q2	tR(ACG)Q2	74 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	ECM4	YKR076W	1113 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	AFB1	YLR040C	675 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	CWC24	YLR323C	780 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	COX8	YLR395C	237 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	SHH3	YMR118C	591 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YBL039W-B	YBL039W-B	180 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	RSM19	YNR037C	276 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YPR053C	YPR053C	456 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YPR096C	YPR096C	303 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	PIS1	YPR113W	663 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	EXO5	YBR163W	1758 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	ARP4	YJL081C	1470 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	PCI8	YIL071C	1335 nt		3.21	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	HBT1	YDL223C	3141 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YDL050C	YDL050C	372 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	MIX14	YDR031W	366 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	AIM11	YER093C-A	414 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YGR053C	YGR053C	852 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	SDO1	YLR022C	753 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	SEN15	YMR059W	387 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YMR304C-A	YMR304C-A	351 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	PBI2	YNL015W	228 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	TOM22	YNL131W	459 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	SVS1	YPL163C	783 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YGR027W-B	YGR027W-B	5268 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YLR227W-B	YLR227W-B	5268 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YPR158C-D	YPR158C-D	5268 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	FRE8	YLR047C	2061 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	BMS1	YPL217C	3552 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	DSF2	YBR007C	2211 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	CHS3	YBR023C	3498 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	CWC2	YDL209C	1020 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YDR230W	YDR230W	348 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	BNA7	YDR428C	786 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	BI2	Q0110	1272 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	LIF1	YGL090W	1266 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YGR051C	YGR051C	324 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YMR013C-A	YMR013C-A	150 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	GPI15	YNL038W	690 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	IGO1	YNL157W	507 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	SFM1	YOR021C	642 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	FAS1	YKL182W	6156 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	PCK1	YKR097W	1650 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YBR259W	YBR259W	2067 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YGR237C	YGR237C	2358 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	MAL33	YBR297W	1407 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YMR018W	YMR018W	1545 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	KAR9	YPL269W	1935 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YBR225W	YBR225W	2703 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	URA2	YJL130C	6645 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	AHC2	YCR082W	387 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	OPI6	YDL096C	327 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YER091C-A	YER091C-A	222 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	USE1	YGL098W	738 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YGL152C	YGL152C	678 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YAP3	YHL009C	993 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	BCD1	YHR040W	1101 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YAL031W-A	YAL031W-A	309 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YLR297W	YLR297W	390 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SIP1	P32578	YHC1	YLR298C	696 nt		3.19	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.6 ms