Protein–RNA interactions for Protein: P31937

HIBADH, 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIBADHP31937 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HIBADHP31937 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIBADHP31937 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms