Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC9P31274 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms