Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA11P31270 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms