Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CLIP1P30622 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLIP1P30622 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms