Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM4SF1P30408 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms