Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND2P30279 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND2P30279 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND2P30279 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND2P30279 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND2P30279 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND2P30279 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND2P30279 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND2P30279 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND2P30279 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND2P30279 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND2P30279 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND2P30279 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND2P30279 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND2P30279 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND2P30279 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND2P30279 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND2P30279 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND2P30279 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND2P30279 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND2P30279 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND2P30279 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND2P30279 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND2P30279 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND2P30279 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND2P30279 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND2P30279 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND2P30279 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND2P30279 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND2P30279 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND2P30279 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND2P30279 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND2P30279 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND2P30279 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND2P30279 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND2P30279 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND2P30279 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND2P30279 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND2P30279 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND2P30279 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND2P30279 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND2P30279 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND2P30279 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND2P30279 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND2P30279 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND2P30279 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND2P30279 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND2P30279 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND2P30279 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND2P30279 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND2P30279 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND2P30279 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms